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Unidad de Genómica y Bioinformática

El grupo dirigido por la Prof. Agregada Dra. Nélida Rodríguez Osorio
está ubicado en la sede Salto.

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Algunas Publicaciones 

Yepes-Blandón JA, Bian C, Benítez-Galeano MJ, Aristizabal-Regino JL, Estrada-Posada AL, Mir D, Vásquez-Machado G, Atencio-García VJ, Shi Q & Rodríguez-Osorio N. (2022) Draft genome assembly for the Colombian freshwater bocachico fish, Prochilodus magdalenae. Frontiers in Genetics. DOI 10.3389/fgene.2022.989788

 

​Giannitti F, da Silva Silveira C, Bullock H, Berón M, Fernández-Ciganda S, Benítez-Galeano, MJ, Rodríguez-Osorio N, Silva-Flannery L, Perdomo Y, Cabrera A, et al. (2022) Bovine Polyomavirus-1 (Epsilonpolyomavirus bovis): An Emerging Fetal Pathogen of Cattle That Causes Renal Lesions Resembling Polyomavirus-Associated Nephropathy of Humans. Viruses. https://doi.org/10.3390/v14092042

 

​Báez F, López Darriulat R, Rodríguez-Osorio N & Viñoles C. (2022) Effect of season on germinal vesicle stage, quality, and subsequent in vitro developmental competence in bovine cumulus-oocyte complexes. J Thermal Biology. doi: 10.1016/j.jtherbio.2021.103171

 

Ramirez-Nieto G, Mir D, Almansa-Villa D, Córdoba-Argotti G, Beltran-Leon M, Rodriguez-Osorio N, Garai J, Zabaleta J & Gómez AP. (2022) New Insights into Avian Infectious Bronchitis Virus in Colombia from Whole-Genome Analysis. Viruses. doi:  10.3390/v14112562.

Parodi P, Armúa-Fernández MT, Schanzembach M, Mir D,Benítez-Galeano MJ, Rodríguez-Osorio N, Rivero R & Venzal JM. (2022) Characterization of strains of Anaplasma marginale from clinical cases in bovine using major surface protein 1a in Uruguay. Front. Vet. Sci. doi: 10.3389/fvets.2022.990228

Mir D, N. Rego, P. C. Resende, and F. López-tort et al., (2021). Recurrent dissemination of SARS-CoV-2 through the Uruguayan- Brazilian border. Front. Microbiol. 28;12:653986.

 

Mir D, Gräf T, Esteves de Matos Almeida S, Pinto AR, Delatorre E, Bello G. Inferring population dynamics of HIV-1 subtype C epidemics in Eastern Africa and Southern Brazil applying different Bayesian phylodynamics approaches., (2018) Sci Rep. 8;8(1):8778.

 

​Urrego R, Bernal-Ulloa SM, Chavarria NA, Herrera-Puerta E, Lucas-Hahn A, Herrman D, Winklers S, Pache D, Niemann H, Rodríguez-Osorio N. (2017). Satellite DNA methylation status and expression of selected genes in Bos indicus blastocysts produced in vivo and in vitro. Zygote 25(2):131-140.

Integrantes

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 Dra. Nélida Rodríguez Osorio

Profesora Agregada y Responsable de la Unidad de Genómica y Bioinformática
(Gdo 4, 40 hs/sem, DT)

CVUy

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Dra. Daiana Mir

Profesora Adjunta 
(Gdo 3, 40 hs/sem, DT)

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Dr. Germán Traglia

Asistente

(Gdo 2, 40 hs/sem)

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Dra. María José Benítez-Galeano

Ayudante
(Gdo 1, 40 hs/sem)

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Lic. Agustina Añasco

Estudiante de Posgrado   

(Maestría en Bioinformática, Becaria ANII)

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Dr. M.V. Diego Almansa-Villa

Estudiante de Posgrado 

   (Maestría en Bioinformática,

Gdo 1, 30 hs/sem)

Integrantes
Publicaciones

Líneas de investigación

a) Embriogenómica: Transcriptómica y epigenómica de la gametogénesis y el desarrollo embrionario en mamíferos.

b) Agrogenómica: Aplicaciones de la genómica en especies de interés agropecuario.

c) Virómica: Filodinámica viral para el análisis de procesos epidémicos.

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Lineas

Colaboraciones

COLABORACIONES ACADÉMICAS CON INSTITUCIONES NACIONALES:

  • Laboratorio de Virología Molecular, DCB

  • Laboratorio de Genética Molecular Humana, DCB

  • Laboratorio de Vectores y Enfermedades transmitidas, DCB

  • Laboratorio de Producción in vitro de embriones, Tacuarembó - CENUR Litoral Noreste.

  • Facultad de Veterinaria, UdelaR Uruguay

  • Instituto de Higiene, UdelaR Uruguay

  • Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay

  • Intitut Pasteur, Montevideo – Uruguay

COLABORACIONES ACADÉMICAS CON INSTITUCIONES EXTRANJERAS:

  • Universidad de Buenos Aires – Argentina  

  • INTA Cerro Azul – Argentina    

  • Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro – Brasil

  • Universidad Nacional sedes Medellín y Bogotá – Colombia

  • Universidad de Antioquia, Medellín – Colombia

  • Universidad CES, Medellín – Colombia

  • Universidad Estatal de Mississippi, Starkville – Estados Unidos

  • Universidad Estatal de California, Fullerton – Estados Unidos

  • Key Lab of Marine Genomics, Shenzhen – China 

Colaboraciones
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